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acc5ab056a
commit
5124098b6c
@ -145,10 +145,6 @@ BpSolver::getJointDistributionOf (const VarIds& jointVarIds)
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void
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void
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BpSolver::runSolver (void)
|
BpSolver::runSolver (void)
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{
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{
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clock_t start;
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if (Constants::COLLECT_STATS) {
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start = clock();
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}
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initializeSolver();
|
initializeSolver();
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||||||
nIters_ = 0;
|
nIters_ = 0;
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||||||
while (!converged() && nIters_ < BpOptions::maxIter) {
|
while (!converged() && nIters_ < BpOptions::maxIter) {
|
||||||
@ -188,14 +184,6 @@ BpSolver::runSolver (void)
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}
|
}
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||||||
cout << endl;
|
cout << endl;
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||||||
}
|
}
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||||||
unsigned size = fg_->varNodes().size();
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||||||
if (Constants::COLLECT_STATS) {
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unsigned nIters = 0;
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bool loopy = fg_->isTree() == false;
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if (loopy) nIters = nIters_;
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double time = (double (clock() - start)) / CLOCKS_PER_SEC;
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Statistics::updateStatistics (size, loopy, nIters, time);
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}
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runned_ = true;
|
runned_ = true;
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}
|
}
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|||||||
@ -3,27 +3,8 @@
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|||||||
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||||||
CbpSolver::CbpSolver (const FactorGraph& fg) : BpSolver (fg)
|
CbpSolver::CbpSolver (const FactorGraph& fg) : BpSolver (fg)
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{
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{
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||||||
unsigned nrGroundVars, nrGroundFacs, nrNeighborless;
|
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||||||
if (Constants::COLLECT_STATS) {
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nrGroundVars = fg_->varNodes().size();
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||||||
nrGroundFacs = fg_->facNodes().size();
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||||||
const VarNodes& vars = fg_->varNodes();
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||||||
nrNeighborless = 0;
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||||||
for (unsigned i = 0; i < vars.size(); i++) {
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const FacNodes& factors = vars[i]->neighbors();
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if (factors.size() == 1 && factors[0]->neighbors().size() == 1) {
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nrNeighborless ++;
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}
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}
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}
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cfg_ = new CFactorGraph (fg);
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cfg_ = new CFactorGraph (fg);
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fg_ = cfg_->getGroundFactorGraph();
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fg_ = cfg_->getGroundFactorGraph();
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||||||
if (Constants::COLLECT_STATS) {
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unsigned nrClusterVars = fg_->varNodes().size();
|
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||||||
unsigned nrClusterFacs = fg_->facNodes().size();
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||||||
Statistics::updateCompressingStatistics (nrGroundVars,
|
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||||||
nrGroundFacs, nrClusterVars, nrClusterFacs, nrNeighborless);
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}
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}
|
}
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||||||
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|||||||
@ -59,8 +59,6 @@ const int NO_EVIDENCE = -1;
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|||||||
// number of digits to show when printing a parameter
|
// number of digits to show when printing a parameter
|
||||||
const unsigned PRECISION = 6;
|
const unsigned PRECISION = 6;
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||||||
|
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||||||
const bool COLLECT_STATS = false;
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||||||
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};
|
};
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||||||
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@ -30,11 +30,6 @@ unsigned maxIter = 1000;
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vector<NetInfo> Statistics::netInfo_;
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vector<CompressInfo> Statistics::compressInfo_;
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||||||
unsigned Statistics::primaryNetCount_;
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||||||
namespace Util {
|
namespace Util {
|
||||||
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||||||
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||||||
@ -426,181 +421,3 @@ pow (Params& v, double exp)
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}
|
}
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||||||
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||||||
|
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||||||
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||||||
unsigned
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Statistics::getSolvedNetworksCounting (void)
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{
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return netInfo_.size();
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}
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void
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Statistics::incrementPrimaryNetworksCounting (void)
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{
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primaryNetCount_ ++;
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}
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||||||
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||||||
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||||||
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|
||||||
unsigned
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Statistics::getPrimaryNetworksCounting (void)
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{
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return primaryNetCount_;
|
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}
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void
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Statistics::updateStatistics (
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unsigned size,
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bool loopy,
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unsigned nIters,
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double time)
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||||||
{
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||||||
netInfo_.push_back (NetInfo (size, loopy, nIters, time));
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}
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||||||
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||||||
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void
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Statistics::printStatistics (void)
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{
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cout << getStatisticString();
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}
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||||||
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void
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Statistics::writeStatistics (const char* fileName)
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{
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ofstream out (fileName);
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||||||
if (!out.is_open()) {
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cerr << "error: cannot open file to write at " ;
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||||||
cerr << "Statistics::writeStats()" << endl;
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abort();
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}
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out << getStatisticString();
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out.close();
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}
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|
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||||||
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void
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||||||
Statistics::updateCompressingStatistics (
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unsigned nrGroundVars,
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unsigned nrGroundFactors,
|
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unsigned nrClusterVars,
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unsigned nrClusterFactors,
|
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||||||
unsigned nrNeighborless)
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||||||
{
|
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||||||
compressInfo_.push_back (CompressInfo (nrGroundVars, nrGroundFactors,
|
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||||||
nrClusterVars, nrClusterFactors, nrNeighborless));
|
|
||||||
}
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||||||
|
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||||||
|
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||||||
|
|
||||||
string
|
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||||||
Statistics::getStatisticString (void)
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{
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||||||
stringstream ss2, ss3, ss4, ss1;
|
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||||||
ss1 << "running mode: " ;
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||||||
switch (Globals::infAlgorithm) {
|
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||||||
case InfAlgorithms::VE: ss1 << "ve" << endl; break;
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|
||||||
case InfAlgorithms::BP: ss1 << "bp" << endl; break;
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|
||||||
case InfAlgorithms::CBP: ss1 << "cbp" << endl; break;
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|
||||||
}
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||||||
ss1 << "message schedule: " ;
|
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||||||
switch (BpOptions::schedule) {
|
|
||||||
case BpOptions::Schedule::SEQ_FIXED:
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||||||
ss1 << "sequential fixed" << endl;
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||||||
break;
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||||||
case BpOptions::Schedule::SEQ_RANDOM:
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||||||
ss1 << "sequential random" << endl;
|
|
||||||
break;
|
|
||||||
case BpOptions::Schedule::PARALLEL:
|
|
||||||
ss1 << "parallel" << endl;
|
|
||||||
break;
|
|
||||||
case BpOptions::Schedule::MAX_RESIDUAL:
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||||||
ss1 << "max residual" << endl;
|
|
||||||
break;
|
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||||||
}
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||||||
ss1 << "max iterations: " << BpOptions::maxIter << endl;
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||||||
ss1 << "accuracy " << BpOptions::accuracy << endl;
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||||||
ss1 << endl << endl;
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||||||
Util::printSubHeader ("Network information", ss2);
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||||||
ss2 << left;
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||||||
ss2 << setw (15) << "Network Size" ;
|
|
||||||
ss2 << setw (9) << "Loopy" ;
|
|
||||||
ss2 << setw (15) << "Iterations" ;
|
|
||||||
ss2 << setw (15) << "Solving Time" ;
|
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||||||
ss2 << endl;
|
|
||||||
unsigned nLoopyNets = 0;
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||||||
unsigned nUnconvergedRuns = 0;
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||||||
double totalSolvingTime = 0.0;
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||||||
for (unsigned i = 0; i < netInfo_.size(); i++) {
|
|
||||||
ss2 << setw (15) << netInfo_[i].size;
|
|
||||||
if (netInfo_[i].loopy) {
|
|
||||||
ss2 << setw (9) << "yes";
|
|
||||||
nLoopyNets ++;
|
|
||||||
} else {
|
|
||||||
ss2 << setw (9) << "no";
|
|
||||||
}
|
|
||||||
if (netInfo_[i].nIters == 0) {
|
|
||||||
ss2 << setw (15) << "n/a" ;
|
|
||||||
} else {
|
|
||||||
ss2 << setw (15) << netInfo_[i].nIters;
|
|
||||||
if (netInfo_[i].nIters > BpOptions::maxIter) {
|
|
||||||
nUnconvergedRuns ++;
|
|
||||||
}
|
|
||||||
}
|
|
||||||
ss2 << setw (15) << netInfo_[i].time;
|
|
||||||
totalSolvingTime += netInfo_[i].time;
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||||||
ss2 << endl;
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|
||||||
}
|
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||||||
ss2 << endl << endl;
|
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||||||
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||||||
unsigned c1 = 0, c2 = 0, c3 = 0, c4 = 0;
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|
||||||
if (compressInfo_.size() > 0) {
|
|
||||||
Util::printSubHeader ("Compress information", ss3);
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||||||
ss3 << left;
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||||||
ss3 << "Ground Cluster Ground Cluster Neighborless" << endl;
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||||||
ss3 << "Vars Vars Factors Factors Vars" << endl;
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||||||
for (unsigned i = 0; i < compressInfo_.size(); i++) {
|
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||||||
ss3 << setw (9) << compressInfo_[i].nrGroundVars;
|
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||||||
ss3 << setw (10) << compressInfo_[i].nrClusterVars;
|
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||||||
ss3 << setw (10) << compressInfo_[i].nrGroundFactors;
|
|
||||||
ss3 << setw (10) << compressInfo_[i].nrClusterFactors;
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||||||
ss3 << setw (10) << compressInfo_[i].nrNeighborless;
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||||||
ss3 << endl;
|
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||||||
c1 += compressInfo_[i].nrGroundVars - compressInfo_[i].nrNeighborless;
|
|
||||||
c2 += compressInfo_[i].nrClusterVars;
|
|
||||||
c3 += compressInfo_[i].nrGroundFactors - compressInfo_[i].nrNeighborless;
|
|
||||||
c4 += compressInfo_[i].nrClusterFactors;
|
|
||||||
if (compressInfo_[i].nrNeighborless != 0) {
|
|
||||||
c2 --;
|
|
||||||
c4 --;
|
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||||||
}
|
|
||||||
}
|
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||||||
ss3 << endl << endl;
|
|
||||||
}
|
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||||||
|
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||||||
ss4 << "primary networks: " << primaryNetCount_ << endl;
|
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||||||
ss4 << "solved networks: " << netInfo_.size() << endl;
|
|
||||||
ss4 << "loopy networks: " << nLoopyNets << endl;
|
|
||||||
ss4 << "unconverged runs: " << nUnconvergedRuns << endl;
|
|
||||||
ss4 << "total solving time: " << totalSolvingTime << endl;
|
|
||||||
if (compressInfo_.size() > 0) {
|
|
||||||
double pc1 = (1.0 - (c2 / (double)c1)) * 100.0;
|
|
||||||
double pc2 = (1.0 - (c4 / (double)c3)) * 100.0;
|
|
||||||
ss4 << setprecision (5);
|
|
||||||
ss4 << "variable compression: " << pc1 << "%" << endl;
|
|
||||||
ss4 << "factor compression: " << pc2 << "%" << endl;
|
|
||||||
}
|
|
||||||
ss4 << endl << endl;
|
|
||||||
|
|
||||||
ss1 << ss4.str() << ss2.str() << ss3.str();
|
|
||||||
return ss1.str();
|
|
||||||
}
|
|
||||||
|
|
||||||
|
|||||||
@ -383,67 +383,5 @@ void pow (Params&, double);
|
|||||||
|
|
||||||
};
|
};
|
||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
struct NetInfo
|
|
||||||
{
|
|
||||||
NetInfo (unsigned size, bool loopy, unsigned nIters, double time)
|
|
||||||
{
|
|
||||||
this->size = size;
|
|
||||||
this->loopy = loopy;
|
|
||||||
this->nIters = nIters;
|
|
||||||
this->time = time;
|
|
||||||
}
|
|
||||||
unsigned size;
|
|
||||||
bool loopy;
|
|
||||||
unsigned nIters;
|
|
||||||
double time;
|
|
||||||
};
|
|
||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
struct CompressInfo
|
|
||||||
{
|
|
||||||
CompressInfo (unsigned a, unsigned b, unsigned c, unsigned d, unsigned e)
|
|
||||||
{
|
|
||||||
nrGroundVars = a;
|
|
||||||
nrGroundFactors = b;
|
|
||||||
nrClusterVars = c;
|
|
||||||
nrClusterFactors = d;
|
|
||||||
nrNeighborless = e;
|
|
||||||
}
|
|
||||||
unsigned nrGroundVars;
|
|
||||||
unsigned nrGroundFactors;
|
|
||||||
unsigned nrClusterVars;
|
|
||||||
unsigned nrClusterFactors;
|
|
||||||
unsigned nrNeighborless;
|
|
||||||
};
|
|
||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
class Statistics
|
|
||||||
{
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||||||
public:
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||||||
static unsigned getSolvedNetworksCounting (void);
|
|
||||||
|
|
||||||
static void incrementPrimaryNetworksCounting (void);
|
|
||||||
|
|
||||||
static unsigned getPrimaryNetworksCounting (void);
|
|
||||||
|
|
||||||
static void updateStatistics (unsigned, bool, unsigned, double);
|
|
||||||
|
|
||||||
static void printStatistics (void);
|
|
||||||
|
|
||||||
static void writeStatistics (const char*);
|
|
||||||
|
|
||||||
static void updateCompressingStatistics (
|
|
||||||
unsigned, unsigned, unsigned, unsigned, unsigned);
|
|
||||||
|
|
||||||
private:
|
|
||||||
static string getStatisticString (void);
|
|
||||||
|
|
||||||
static vector<NetInfo> netInfo_;
|
|
||||||
static vector<CompressInfo> compressInfo_;
|
|
||||||
static unsigned primaryNetCount_;
|
|
||||||
};
|
|
||||||
|
|
||||||
#endif // HORUS_UTIL_H
|
#endif // HORUS_UTIL_H
|
||||||
|
|
||||||
|
|||||||
Reference in New Issue
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